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<!--
protein.php permet a l'utilisateur d'avoir un resumé d'information sur une sequence proteique
de gene contenu dans la Bases de données, juste en ayant spécifier son identifiant.
-->
<html lang="en">
<head>
<meta charset="UTF-8">
<link rel="stylesheet" type="text/css" href="base.css">
<title>Protein information - BIO-Analysis tools</title>
</head>
<body>
<div class="header">
<!-- L'entete du site web -->
<?php include("barre_recherche.php"); ?>
</div>
<div class="mega_container">
<TABLE>
<?php
$exist = 0;
if ((isset($_POST['id_prot'])) && ($_POST['id_prot'] != '')){
$protein_a = $_POST['id_prot'];
try
{
// On se connecte à MySQL
$bdd = new PDO('mysql:host=localhost;dbname=GENOME_BOTRYTIS_CINEREA;charset=utf8', 'root', '');
}
catch(Exception $e)
{
// En cas d'erreur, on affiche un message et on arrête tout
die('Erreur : '.$e->getMessage());
}
$proteine = $bdd->query("SELECT * FROM proteine WHERE id_prot = '$protein_a'");
$proteine->closeCursor();
$exist = 1;
}else{
$protein_a = "";
}
?>
</TABLE>
<!-- MAIN -->
<div class="main_container">
<p><p style="text-align:center"><b>Protein information</b></style></p>
<form action="<?php echo $_SERVER['PHP_SELF']; ?>" method="post">
<p><p style="text-align:left;">Veuillez entrer votre identifiant de proteine.</style></p><br>
<input type = "string" name="id_prot" rows = "1" cols= "50" placeholder="BC1T_00005"/>
<!-- Bouton pour affichage de resultat -->
<input type="submit" value="search" />
<br><br>
<?php if ($exist ==1){
echo '<table align="center" width="50%" border="1" cellpadding="3px" cellspacing="0" bgcolor="">
<tr><th bgcolor="" colspan="">Resultat</th></tr>
<tr><td>';
try
{
// On se connecte à MySQL
$bdd = new PDO('mysql:host=localhost;dbname=GENOME_BOTRYTIS_CINEREA;charset=utf8', 'root', '');
}
catch(Exception $e)
{
// En cas d'erreur, on affiche un message et on arrête tout
die('Erreur : '.$e->getMessage());
}
$proteine = $bdd->query("SELECT * FROM proteine WHERE id_prot = '$protein_a'");
// affichage des infos sur le transcrit du gene
// Affichage de la sequence proteique du gene
$i=0;
while ($data = $proteine->fetch()){
$i++;
echo '<p><font style="text-align:center" face="sans-serif" color="#BB0000" size="3">SUMMARY</font></p>';
echo "\t"."Protein indentifiant : ".$protein_a.'<br>';
echo "\t"."Gene indentifiant : ".$data['id_gene'].'<br>';
echo "\t"."Protein description : ".$data['des_prot'].'<br>';
echo "\t"."Organisme : Botrytis Cinerea ".'<br>';
echo '<p><font style="text-align:center" face="sans-serif" color="#BB0000" size="3">GENOMIC CONTEXT</font></p>';
echo "\t"."Protein length : ".$data['length_prot'].'<br>';
echo "\t"."Sequence : ".'<br>';
}$proteine->closeCursor();
if ($data != $proteine) { // Si le bon identifiant de proteine n'est pas fournit alors
//echo "Identifiant de proteine incorrect\n";
}
echo '
</tr></td>
</table>';
}
?>
</td>
<br><br><br>
</form>
<p><i><a href="main.php">Back to homepage</a></i></p>
<br><br>
</div>
</div>
<!-- FOOTER -->
<footer>
<?php include("footer.php"); ?>
</footer>
</body>
</html>