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<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN" "http://www.w3.org/TR/html4/loose.dtd">
<!-- NewPage -->
<html lang="fr">
<head>
<!-- Generated by javadoc (9.0.4) on Mon May 28 16:46:41 CEST 2018 -->
<title>Index</title>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8">
<meta name="date" content="2018-05-28">
<link rel="stylesheet" type="text/css" href="stylesheet.css" title="Style">
<link rel="stylesheet" type="text/css" href="jquery/jquery-ui.css" title="Style">
<script type="text/javascript" src="script.js"></script>
<script type="text/javascript" src="jquery/jszip/dist/jszip.min.js"></script>
<script type="text/javascript" src="jquery/jszip-utils/dist/jszip-utils.min.js"></script>
<!--[if IE]>
<script type="text/javascript" src="jquery/jszip-utils/dist/jszip-utils-ie.min.js"></script>
<![endif]-->
<script type="text/javascript" src="jquery/jquery-1.10.2.js"></script>
<script type="text/javascript" src="jquery/jquery-ui.js"></script>
</head>
<body>
<script type="text/javascript"><!--
try {
if (location.href.indexOf('is-external=true') == -1) {
parent.document.title="Index";
}
}
catch(err) {
}
//-->
var pathtoroot = "./";loadScripts(document, 'script');</script>
<noscript>
<div>JavaScript is disabled on your browser.</div>
</noscript>
<div class="fixedNav">
<!-- ========= START OF TOP NAVBAR ======= -->
<div class="topNav"><a name="navbar.top">
<!-- -->
</a>
<div class="skipNav"><a href="#skip.navbar.top" title="Skip navigation links">Skip navigation links</a></div>
<a name="navbar.top.firstrow">
<!-- -->
</a>
<ul class="navList" title="Navigation">
<li><a href="package-summary.html">Package</a></li>
<li>Class</li>
<li><a href="overview-tree.html">Tree</a></li>
<li><a href="deprecated-list.html">Deprecated</a></li>
<li class="navBarCell1Rev">Index</li>
<li><a href="help-doc.html">Help</a></li>
</ul>
</div>
<div class="subNav">
<ul class="navList">
<li>Prev</li>
<li>Next</li>
</ul>
<ul class="navList">
<li><a href="index.html?index-all.html" target="_top">Frames</a></li>
<li><a href="index-all.html" target="_top">No Frames</a></li>
</ul>
<ul class="navList" id="allclasses_navbar_top">
<li><a href="allclasses-noframe.html">All Classes</a></li>
</ul>
<ul class="navListSearch">
<li><span>SEARCH: </span>
<input type="text" id="search" value=" " disabled="disabled">
<input type="reset" id="reset" value=" " disabled="disabled">
</li>
</ul>
<div>
<script type="text/javascript"><!--
allClassesLink = document.getElementById("allclasses_navbar_top");
if(window==top) {
allClassesLink.style.display = "block";
}
else {
allClassesLink.style.display = "none";
}
//-->
</script>
<noscript>
<div>JavaScript is disabled on your browser.</div>
</noscript>
</div>
<a name="skip.navbar.top">
<!-- -->
</a></div>
<!-- ========= END OF TOP NAVBAR ========= -->
</div>
<div class="navPadding"> </div>
<script type="text/javascript"><!--
$('.navPadding').css('padding-top', $('.fixedNav').css("height"));
//-->
</script>
<div class="contentContainer"><a href="#I:A">A</a> <a href="#I:B">B</a> <a href="#I:C">C</a> <a href="#I:E">E</a> <a href="#I:G">G</a> <a href="#I:I">I</a> <a href="#I:J">J</a> <a href="#I:K">K</a> <a href="#I:M">M</a> <a href="#I:P">P</a> <a href="#I:R">R</a> <a href="#I:S">S</a> <a href="#I:U">U</a> <a href="#I:V">V</a> <a href="#I:X">X</a> <a href="#I:Y">Y</a> <a name="I:A">
<!-- -->
</a>
<h2 class="title">A</h2>
<dl>
<dt><span class="memberNameLink"><a href="KEGGBrowser.html#actionPerformed-java.awt.event.ActionEvent-">actionPerformed(ActionEvent)</a></span> - Method in class <a href="KEGGBrowser.html" title="class in <Unnamed>">KEGGBrowser</a></dt>
<dd>
<div class="block">Implementer la methode actionPerformed(ActionEvent e) pour l'interface ActionListener permet :
1. si bouton du GenomeBrowser pressé
- Mettre à jour la page web dans la fenetre genomebrowser
- Importer les informations sur le gene
- Afficher dans quelle(s) réaction(s) est impliqué ce gène
- OU afficher un message d'erreur si info.txt introuvable
2. si bouton du PathwayBrowser pressé
- Mettre à jour l'image affichée dans pathwaybrowser
- Importer les information sur un réaction par défaut
- Afficher les gène(s) qui catalyse(nt) cette réaction
- OU Afficher un message d'erreur si image.png introuvable
3. si bouton Image du GeneInformationPanel pressé
- Afficher détails de la réaction dans pathwaybrowser</div>
</dd>
</dl>
<a name="I:B">
<!-- -->
</a>
<h2 class="title">B</h2>
<dl>
<dt><span class="memberNameLink"><a href="GenomeBrowser.html#bouton">bouton</a></span> - Variable in class <a href="GenomeBrowser.html" title="class in <Unnamed>">GenomeBrowser</a></dt>
<dd>
<div class="block">Bouton "Search" pour afficher contexte génomique, information sur gène et réaction(s) éventuelle(s) associée(s)</div>
</dd>
<dt><span class="memberNameLink"><a href="InformationPanel.html#bouton">bouton</a></span> - Variable in class <a href="InformationPanel.html" title="class in <Unnamed>">InformationPanel</a></dt>
<dd>
<div class="block">Bouton "Image" pour afficher le détail de la réaction dans le PathwayBrowser
(Uniquement présent dans Reaction InformationPanel)</div>
</dd>
<dt><span class="memberNameLink"><a href="PathwayBrowser.html#bouton">bouton</a></span> - Variable in class <a href="PathwayBrowser.html" title="class in <Unnamed>">PathwayBrowser</a></dt>
<dd>
<div class="block">Bouton "Search" pour afficher voie métabolique, information sur la réaction par défaut
et liste des gène(s) impliqué(s) dans cette réaction (si présents chez organisme)</div>
</dd>
</dl>
<a name="I:C">
<!-- -->
</a>
<h2 class="title">C</h2>
<dl>
<dt><span class="memberNameLink"><a href="Reactor.html#contains-int-int-">contains(int, int)</a></span> - Method in class <a href="Reactor.html" title="class in <Unnamed>">Reactor</a></dt>
<dd>
<div class="block">Vérifie si les coordonnées du Point fournies en argument sont inclues dans le rectangle du Reactor</div>
</dd>
</dl>
<a name="I:E">
<!-- -->
</a>
<h2 class="title">E</h2>
<dl>
<dt><span class="memberNameLink"><a href="InformationPanel.html#errorInfo-java.lang.String-">errorInfo(String)</a></span> - Method in class <a href="InformationPanel.html" title="class in <Unnamed>">InformationPanel</a></dt>
<dd>
<div class="block">Erreur d'Affichage : fichier .txt ou .conf inexistant</div>
</dd>
</dl>
<a name="I:G">
<!-- -->
</a>
<h2 class="title">G</h2>
<dl>
<dt><span class="memberNameLink"><a href="Reactor.html#geneList">geneList</a></span> - Variable in class <a href="Reactor.html" title="class in <Unnamed>">Reactor</a></dt>
<dd>
<div class="block">Liste des gènes impliqués dans la réaction associée</div>
</dd>
<dt><a href="GenomeBrowser.html" title="class in <Unnamed>"><span class="typeNameLink">GenomeBrowser</span></a> - Class in <a href="package-summary.html"><Unnamed></a></dt>
<dd>
<div class="block">La classe GenomeBrowser est une fenetre web qui affiche le contexte génomique d'un gène donné.</div>
</dd>
<dt><span class="memberNameLink"><a href="GenomeBrowser.html#GenomeBrowser--">GenomeBrowser()</a></span> - Constructor for class <a href="GenomeBrowser.html" title="class in <Unnamed>">GenomeBrowser</a></dt>
<dd>
<div class="block">Constructeur de la classe GenomeBrowser</div>
</dd>
<dt><span class="memberNameLink"><a href="GenomeBrowser.html#getFieldID--">getFieldID()</a></span> - Method in class <a href="GenomeBrowser.html" title="class in <Unnamed>">GenomeBrowser</a></dt>
<dd>
<div class="block">Retourne identifiant de gène dans le champ de Texte GeneID</div>
</dd>
<dt><span class="memberNameLink"><a href="PathwayBrowser.html#getFieldID--">getFieldID()</a></span> - Method in class <a href="PathwayBrowser.html" title="class in <Unnamed>">PathwayBrowser</a></dt>
<dd>
<div class="block">Retourne identifiant de la voie métabolique dans le champ de Texte GeneID</div>
</dd>
<dt><span class="memberNameLink"><a href="GenomeBrowser.html#getFieldSp--">getFieldSp()</a></span> - Method in class <a href="GenomeBrowser.html" title="class in <Unnamed>">GenomeBrowser</a></dt>
<dd>
<div class="block">Retourne identifiant d'organisme dans le champ de Texte Species</div>
</dd>
<dt><span class="memberNameLink"><a href="PathwayBrowser.html#getFieldSp--">getFieldSp()</a></span> - Method in class <a href="PathwayBrowser.html" title="class in <Unnamed>">PathwayBrowser</a></dt>
<dd>
<div class="block">Retourne identifiant d'organisme dans le champ de Texte Species</div>
</dd>
</dl>
<a name="I:I">
<!-- -->
</a>
<h2 class="title">I</h2>
<dl>
<dt><span class="memberNameLink"><a href="PathwayBrowser.html#image">image</a></span> - Variable in class <a href="PathwayBrowser.html" title="class in <Unnamed>">PathwayBrowser</a></dt>
<dd>
<div class="block">Image affichée dans le JPanel du PathwayBrowser</div>
</dd>
<dt><span class="memberNameLink"><a href="PathwayBrowser.html#imglabel">imglabel</a></span> - Variable in class <a href="PathwayBrowser.html" title="class in <Unnamed>">PathwayBrowser</a></dt>
<dd>
<div class="block">Cadre affichant l'image dans le JPanel du PathwayBrowser</div>
</dd>
<dt><span class="memberNameLink"><a href="PathwayBrowser.ImgLabel.html#ImgLabel-javax.swing.ImageIcon-">ImgLabel(ImageIcon)</a></span> - Constructor for class <a href="PathwayBrowser.ImgLabel.html" title="class in <Unnamed>">PathwayBrowser.ImgLabel</a></dt>
<dd>
<div class="block">Constructeur de la classe interne ImgLabel</div>
</dd>
<dt><a href="InformationPanel.html" title="class in <Unnamed>"><span class="typeNameLink">InformationPanel</span></a> - Class in <a href="package-summary.html"><Unnamed></a></dt>
<dd>
<div class="block">La classe InformationPanel permet d'importer d'un fichier .txt et d'afficher des informations
relatives soit à un gène donnée, soit à une réaction donnée.</div>
</dd>
<dt><span class="memberNameLink"><a href="InformationPanel.html#InformationPanel-java.lang.String-">InformationPanel(String)</a></span> - Constructor for class <a href="InformationPanel.html" title="class in <Unnamed>">InformationPanel</a></dt>
<dd>
<div class="block">Constructeur de InformationPanel</div>
</dd>
<dt><a href="InvolvePanel.html" title="class in <Unnamed>"><span class="typeNameLink">InvolvePanel</span></a> - Class in <a href="package-summary.html"><Unnamed></a></dt>
<dd>
<div class="block">La classe InvolvePanel correspond à la fenetre de sélection qui contient
soit la liste des gènes impliqués dans une réaction donnée,
soit la liste des réactions catalysées par un gène donné.</div>
</dd>
<dt><span class="memberNameLink"><a href="InvolvePanel.html#InvolvePanel-java.lang.String-">InvolvePanel(String)</a></span> - Constructor for class <a href="InvolvePanel.html" title="class in <Unnamed>">InvolvePanel</a></dt>
<dd>
<div class="block">Constructeur de la classe InvolvePanel</div>
</dd>
</dl>
<a name="I:J">
<!-- -->
</a>
<h2 class="title">J</h2>
<dl>
<dt><span class="memberNameLink"><a href="InvolvePanel.html#jlist">jlist</a></span> - Variable in class <a href="InvolvePanel.html" title="class in <Unnamed>">InvolvePanel</a></dt>
<dd>
<div class="block">Fenetre à sélection contenant une liste d'items impliqués (gènes/réactions)</div>
</dd>
</dl>
<a name="I:K">
<!-- -->
</a>
<h2 class="title">K</h2>
<dl>
<dt><a href="KEGGBrowser.html" title="class in <Unnamed>"><span class="typeNameLink">KEGGBrowser</span></a> - Class in <a href="package-summary.html"><Unnamed></a></dt>
<dd>
<div class="block">La classe KEGGBrowser est une application intéractive JAVA développée à l'intention des Biologistes
et BioInformaticiens.</div>
</dd>
<dt><span class="memberNameLink"><a href="KEGGBrowser.html#KEGGBrowser--">KEGGBrowser()</a></span> - Constructor for class <a href="KEGGBrowser.html" title="class in <Unnamed>">KEGGBrowser</a></dt>
<dd>
<div class="block">Constructeur de la classe KEGGBrowser</div>
</dd>
</dl>
<a name="I:M">
<!-- -->
</a>
<h2 class="title">M</h2>
<dl>
<dt><span class="memberNameLink"><a href="KEGGBrowser.html#main-java.lang.String:A-">main(String[])</a></span> - Static method in class <a href="KEGGBrowser.html" title="class in <Unnamed>">KEGGBrowser</a></dt>
<dd>
<div class="block">Méthode main qui crée la frame KEGGBrowser et redimensionne à tout moment :
- la frame de l'application KEGGBrowser
- la JList des fenetres InvolvePanels</div>
</dd>
<dt><span class="memberNameLink"><a href="KEGGBrowser.html#MAJ_redimensioning--">MAJ_redimensioning()</a></span> - Method in class <a href="KEGGBrowser.html" title="class in <Unnamed>">KEGGBrowser</a></dt>
<dd>
<div class="block">Redimensionnage de la fenetre et des InvolvePanels</div>
</dd>
<dt><span class="memberNameLink"><a href="KEGGBrowser.html#mouseClicked-java.awt.event.MouseEvent-">mouseClicked(MouseEvent)</a></span> - Method in class <a href="KEGGBrowser.html" title="class in <Unnamed>">KEGGBrowser</a></dt>
<dd>
<div class="block">Redéfinir la méthode MouseClicked(MouseEvent me)
Elle permet de changer de reaction_def et de redéssiner le rectangle rouge associé</div>
</dd>
<dt><span class="memberNameLink"><a href="KEGGBrowser.html#mouseEntered-java.awt.event.MouseEvent-">mouseEntered(MouseEvent)</a></span> - Method in class <a href="KEGGBrowser.html" title="class in <Unnamed>">KEGGBrowser</a></dt>
<dd>
<div class="block">Redéfinir la méthode MouseEntered(MouseEvent me)</div>
</dd>
<dt><span class="memberNameLink"><a href="KEGGBrowser.html#mouseExited-java.awt.event.MouseEvent-">mouseExited(MouseEvent)</a></span> - Method in class <a href="KEGGBrowser.html" title="class in <Unnamed>">KEGGBrowser</a></dt>
<dd>
<div class="block">Redéfinir la méthode MouseExited(MouseEvent me)</div>
</dd>
<dt><span class="memberNameLink"><a href="KEGGBrowser.html#mousePressed-java.awt.event.MouseEvent-">mousePressed(MouseEvent)</a></span> - Method in class <a href="KEGGBrowser.html" title="class in <Unnamed>">KEGGBrowser</a></dt>
<dd>
<div class="block">Redéfinir la méthode MousePressed(MouseEvent me)</div>
</dd>
<dt><span class="memberNameLink"><a href="KEGGBrowser.html#mouseReleased-java.awt.event.MouseEvent-">mouseReleased(MouseEvent)</a></span> - Method in class <a href="KEGGBrowser.html" title="class in <Unnamed>">KEGGBrowser</a></dt>
<dd>
<div class="block">Redéfinir la méthode MouseReleased(MouseEvent me)</div>
</dd>
</dl>
<a name="I:P">
<!-- -->
</a>
<h2 class="title">P</h2>
<dl>
<dt><span class="memberNameLink"><a href="PathwayBrowser.ImgLabel.html#paintComponent-java.awt.Graphics-">paintComponent(Graphics)</a></span> - Method in class <a href="PathwayBrowser.ImgLabel.html" title="class in <Unnamed>">PathwayBrowser.ImgLabel</a></dt>
<dd>
<div class="block">Réécriture de la méthode paintComponent pour afficher ou non le rectangle rouge de sélection</div>
</dd>
<dt><span class="memberNameLink"><a href="GenomeBrowser.html#Parsing-java.lang.String-java.lang.String-">Parsing(String, String)</a></span> - Method in class <a href="GenomeBrowser.html" title="class in <Unnamed>">GenomeBrowser</a></dt>
<dd>
<div class="block">Parseur de fichier .txt à la recherche de metabolic pathways .conf à parser à leur tour
MAJ de reaclList, la liste de réaction(s) éventuelle(s) associée(s) au gène donné</div>
</dd>
<dt><span class="memberNameLink"><a href="PathwayBrowser.html#Parsing-java.lang.String-java.lang.String-java.lang.String-">Parsing(String, String, String)</a></span> - Method in class <a href="PathwayBrowser.html" title="class in <Unnamed>">PathwayBrowser</a></dt>
<dd>
<div class="block">Parseur de fichier .conf et Recherche d'expressions régulière
MAJ de reactorList, la liste de réactions impliquées dans la voie métabolique donnée
MAJ du reactor_def, la réaction choisie par défaut ou définié par l'utilisateur avec reacID</div>
</dd>
<dt><a href="PathwayBrowser.html" title="class in <Unnamed>"><span class="typeNameLink">PathwayBrowser</span></a> - Class in <a href="package-summary.html"><Unnamed></a></dt>
<dd>
<div class="block">La classe PathwayBrowser affiche en image le réseau de réactions impliquées dans une voie
métabolique donnée.</div>
</dd>
<dt><span class="memberNameLink"><a href="PathwayBrowser.html#PathwayBrowser--">PathwayBrowser()</a></span> - Constructor for class <a href="PathwayBrowser.html" title="class in <Unnamed>">PathwayBrowser</a></dt>
<dd>
<div class="block">Constructeur de la classe PathwayBrowser</div>
</dd>
<dt><a href="PathwayBrowser.ImgLabel.html" title="class in <Unnamed>"><span class="typeNameLink">PathwayBrowser.ImgLabel</span></a> - Class in <a href="package-summary.html"><Unnamed></a></dt>
<dd>
<div class="block">Classe interne qui contient un fichier .png or .gif et un rectangle rouge de sélection</div>
</dd>
</dl>
<a name="I:R">
<!-- -->
</a>
<h2 class="title">R</h2>
<dl>
<dt><span class="memberNameLink"><a href="Reactor.html#reacID">reacID</a></span> - Variable in class <a href="Reactor.html" title="class in <Unnamed>">Reactor</a></dt>
<dd>
<div class="block">Identifiant de la réaction associé au rectangle</div>
</dd>
<dt><span class="memberNameLink"><a href="GenomeBrowser.html#reacList">reacList</a></span> - Variable in class <a href="GenomeBrowser.html" title="class in <Unnamed>">GenomeBrowser</a></dt>
<dd>
<div class="block">Liste de(s) réaction(s) éventuelle(s) catalysée(s) par le gène</div>
</dd>
<dt><a href="Reactor.html" title="class in <Unnamed>"><span class="typeNameLink">Reactor</span></a> - Class in <a href="package-summary.html"><Unnamed></a></dt>
<dd>
<div class="block">La classe Reactor fait correspondre à chaque rectangle (défini par deux coordonnées) présent
dans les fichier .conf d'une voie métabolique, à un identifiant de réaction et à une liste
de gènes impliquées dans cette réaction pour un organisme donné.</div>
</dd>
<dt><span class="memberNameLink"><a href="Reactor.html#Reactor-int-int-int-int-java.lang.String-">Reactor(int, int, int, int, String)</a></span> - Constructor for class <a href="Reactor.html" title="class in <Unnamed>">Reactor</a></dt>
<dd>
<div class="block">Constructeur de la classe Reactor</div>
</dd>
<dt><span class="memberNameLink"><a href="PathwayBrowser.html#reactor_def">reactor_def</a></span> - Variable in class <a href="PathwayBrowser.html" title="class in <Unnamed>">PathwayBrowser</a></dt>
<dd>
<div class="block">Réaction par défaut ou définie par l'utilisateur après sélection</div>
</dd>
<dt><span class="memberNameLink"><a href="PathwayBrowser.html#reactorList">reactorList</a></span> - Variable in class <a href="PathwayBrowser.html" title="class in <Unnamed>">PathwayBrowser</a></dt>
<dd>
<div class="block">Liste de toutes les réactions impliquées dans la voie métabolique</div>
</dd>
<dt><span class="memberNameLink"><a href="InformationPanel.html#reSize-java.awt.Dimension-">reSize(Dimension)</a></span> - Method in class <a href="InformationPanel.html" title="class in <Unnamed>">InformationPanel</a></dt>
<dd>
<div class="block">Adapter la taille du ScrollPane à la taille du InformationPanel</div>
</dd>
<dt><span class="memberNameLink"><a href="InvolvePanel.html#reSize-java.awt.Dimension-">reSize(Dimension)</a></span> - Method in class <a href="InvolvePanel.html" title="class in <Unnamed>">InvolvePanel</a></dt>
<dd>
<div class="block">Adapter la taille du ScrollPane à la taille du InvolvePanel</div>
</dd>
</dl>
<a name="I:S">
<!-- -->
</a>
<h2 class="title">S</h2>
<dl>
<dt><span class="memberNameLink"><a href="GenomeBrowser.html#setFieldID-java.lang.String-">setFieldID(String)</a></span> - Method in class <a href="GenomeBrowser.html" title="class in <Unnamed>">GenomeBrowser</a></dt>
<dd>
<div class="block">Inscrire identifiant de gène dans le champ de Texte GeneID</div>
</dd>
<dt><span class="memberNameLink"><a href="PathwayBrowser.html#setFieldID-java.lang.String-">setFieldID(String)</a></span> - Method in class <a href="PathwayBrowser.html" title="class in <Unnamed>">PathwayBrowser</a></dt>
<dd>
<div class="block">Inscrire identifiant de la voie métabolique dans le champ de Texte GeneID</div>
</dd>
<dt><span class="memberNameLink"><a href="GenomeBrowser.html#setFieldSp-java.lang.String-">setFieldSp(String)</a></span> - Method in class <a href="GenomeBrowser.html" title="class in <Unnamed>">GenomeBrowser</a></dt>
<dd>
<div class="block">Inscrire identifiant d'organisme dans le champ de Texte Species</div>
</dd>
<dt><span class="memberNameLink"><a href="PathwayBrowser.html#setFieldSp-java.lang.String-">setFieldSp(String)</a></span> - Method in class <a href="PathwayBrowser.html" title="class in <Unnamed>">PathwayBrowser</a></dt>
<dd>
<div class="block">Inscrire identifiant d'organisme dans le champ de Texte Species</div>
</dd>
</dl>
<a name="I:U">
<!-- -->
</a>
<h2 class="title">U</h2>
<dl>
<dt><span class="memberNameLink"><a href="PathwayBrowser.html#updateImg-java.lang.String-java.lang.String-">updateImg(String, String)</a></span> - Method in class <a href="PathwayBrowser.html" title="class in <Unnamed>">PathwayBrowser</a></dt>
<dd>
<div class="block">Mise à jour de l'image .png (pour une voie métabolique) dans la fenetre PathwayBrowser</div>
</dd>
<dt><span class="memberNameLink"><a href="InformationPanel.html#updateInfo-java.lang.String-java.lang.String-">updateInfo(String, String)</a></span> - Method in class <a href="InformationPanel.html" title="class in <Unnamed>">InformationPanel</a></dt>
<dd>
<div class="block">Mettre à jour information sur gene dans InformationPanel</div>
</dd>
<dt><span class="memberNameLink"><a href="InvolvePanel.html#updateJList-javax.swing.DefaultListModel-">updateJList(DefaultListModel<String>)</a></span> - Method in class <a href="InvolvePanel.html" title="class in <Unnamed>">InvolvePanel</a></dt>
<dd>
<div class="block">Mise à jour de la JList</div>
</dd>
<dt><span class="memberNameLink"><a href="GenomeBrowser.html#updatePage-java.lang.String-java.lang.String-">updatePage(String, String)</a></span> - Method in class <a href="GenomeBrowser.html" title="class in <Unnamed>">GenomeBrowser</a></dt>
<dd>
<div class="block">Mise à jour de la page web sur contexte génomique dans la fenetre BrowserPane</div>
</dd>
<dt><span class="memberNameLink"><a href="PathwayBrowser.html#updateReac-java.lang.String-">updateReac(String)</a></span> - Method in class <a href="PathwayBrowser.html" title="class in <Unnamed>">PathwayBrowser</a></dt>
<dd>
<div class="block">Mise à jour de l'image .gif (pour une réaction) dans la fenetre PathwayBrowser</div>
</dd>
</dl>
<a name="I:V">
<!-- -->
</a>
<h2 class="title">V</h2>
<dl>
<dt><span class="memberNameLink"><a href="KEGGBrowser.html#valueChanged-javax.swing.event.ListSelectionEvent-">valueChanged(ListSelectionEvent)</a></span> - Method in class <a href="KEGGBrowser.html" title="class in <Unnamed>">KEGGBrowser</a></dt>
<dd>
<div class="block">Implementer la methode valueChanged(ListSelectionEvent e) pour l'interface ListSelectionListener permet :
1. si l'évenement vient du InvolvesGenes Panel
- Inscrit les identifiants d'organisme et de gène dans les champs de texte de GenomeBrowser
- Mettre à jour la page web dans la fenetre genomebrowser
- Importer les informations sur le gene
- Afficher dans quelle(s) réaction(s) est impliqué ce gène
2. si l'évenement vient du InvolvedInReactions Panel
- Inscrit les identifiants d'organisme et de voie métabolique dans les champs de texte de PathwayBrowser
- Mettre à jour l'image affichée dans pathwaybrowser
- Importer les information sur un réaction par défaut
- Afficher les gène(s) qui catalyse(nt) cette réaction</div>
</dd>
</dl>
<a name="I:X">
<!-- -->
</a>
<h2 class="title">X</h2>
<dl>
<dt><span class="memberNameLink"><a href="Reactor.html#X1">X1</a></span> - Variable in class <a href="Reactor.html" title="class in <Unnamed>">Reactor</a></dt>
<dd>
<div class="block">Abscisse X1 du coin supérieur gauche du rectangle</div>
</dd>
<dt><span class="memberNameLink"><a href="Reactor.html#X2">X2</a></span> - Variable in class <a href="Reactor.html" title="class in <Unnamed>">Reactor</a></dt>
<dd>
<div class="block">Abscisse X2 du coin inférieur droit du rectangle</div>
</dd>
</dl>
<a name="I:Y">
<!-- -->
</a>
<h2 class="title">Y</h2>
<dl>
<dt><span class="memberNameLink"><a href="Reactor.html#Y1">Y1</a></span> - Variable in class <a href="Reactor.html" title="class in <Unnamed>">Reactor</a></dt>
<dd>
<div class="block">Ordonnée Y1 du coin supérieur gauche du rectangle</div>
</dd>
<dt><span class="memberNameLink"><a href="Reactor.html#Y2">Y2</a></span> - Variable in class <a href="Reactor.html" title="class in <Unnamed>">Reactor</a></dt>
<dd>
<div class="block">Ordonnée Y2 du coin inférieur droit du rectangle</div>
</dd>
</dl>
<a href="#I:A">A</a> <a href="#I:B">B</a> <a href="#I:C">C</a> <a href="#I:E">E</a> <a href="#I:G">G</a> <a href="#I:I">I</a> <a href="#I:J">J</a> <a href="#I:K">K</a> <a href="#I:M">M</a> <a href="#I:P">P</a> <a href="#I:R">R</a> <a href="#I:S">S</a> <a href="#I:U">U</a> <a href="#I:V">V</a> <a href="#I:X">X</a> <a href="#I:Y">Y</a> </div>
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