diff --git a/history_barcodes/usher_barcodes11_20_2024-00-48.feather b/history_barcodes/usher_barcodes11_20_2024-00-48.feather new file mode 100644 index 0000000..6ee9990 Binary files /dev/null and b/history_barcodes/usher_barcodes11_20_2024-00-48.feather differ diff --git a/history_lineage_hierarchy/lineages11_20_2024-00-48.yml b/history_lineage_hierarchy/lineages11_20_2024-00-48.yml new file mode 100644 index 0000000..b970b68 --- /dev/null +++ b/history_lineage_hierarchy/lineages11_20_2024-00-48.yml @@ -0,0 +1,45803 @@ +- name: A + alias: A + children: + - A + - A.1 + - A.2 + - A.2.2 + - A.2.3 + - A.2.4 + - A.2.5 + - A.2.5.1 + - A.2.5.2 + - A.2.5.3 + - A.3 + - A.4 + - A.5 + - A.6 + - A.7 + - A.9 + - A.11 + - A.12 + - A.15 + - A.16 + - A.17 + - A.18 + - A.19 + - A.21 + - A.22 + - A.23 + - A.23.1 + - A.24 + - A.25 + - A.26 + - A.27 + - A.28 + - A.29 + - A.30 +- name: A.1 + alias: A.1 + children: + - A.1 + parent: A +- name: A.2 + alias: A.2 + children: + - A.2 + - A.2.2 + - A.2.3 + - 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"C28958A", "A29510C" ], - "JN.1.18": [ + "JN.1.56": [ "C241T", "T670G", "C897A", @@ -185726,7 +185726,6 @@ "A22556G", "G22577C", "G22578A", - "G22599C", "A22629C", "C22674T", "T22679C", @@ -185770,6 +185769,7 @@ "C25000T", "C25207T", "C25584T", + "C26029A", "C26060T", "C26270T", "G26529C", @@ -185793,7 +185793,7 @@ "C28958A", "A29510C" ], - "JN.1.56": [ + "JN.1.20": [ "C241T", "T670G", "C897A", @@ -185832,6 +185832,7 @@ "C21618T", "C21622T", "G21624C", + "C21654T", "C21711T", "G21941T", "T22032C", @@ -185887,7 +185888,6 @@ "C25000T", "C25207T", "C25584T", - "C26029A", "C26060T", "C26270T", "G26529C", @@ -185911,7 +185911,7 @@ "C28958A", "A29510C" ], - "JN.1.20": [ + "JN.1.8": [ "C241T", "T670G", "C897A", @@ -185950,7 +185950,6 @@ "C21618T", "C21622T", "G21624C", - "C21654T", "C21711T", "G21941T", "T22032C", @@ -186019,6 +186018,7 @@ "G27382C", "A27383T", "T27384C", + "C27476T", "C27807T", "T27810C", "A28271T", @@ -186029,7 +186029,7 @@ "C28958A", "A29510C" ], - "JN.1.8": [ + "JN.1.58": 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-196418,10 +196418,12 @@ "C18894T", "C19955T", "A20055G", + "A21137G", "C21618T", "C21622T", "G21624C", "C21711T", + "T21740C", "G21941T", "T22032C", "C22033A", @@ -196450,7 +196452,6 @@ "C22916T", "T22917G", "T22926C", - "T22928G", "T22942A", "G22992A", "C22995A", @@ -196490,7 +196491,6 @@ "G27382C", "A27383T", "T27384C", - "G27415A", "C27807T", "T27810C", "A28271T", @@ -196501,7 +196501,7 @@ "C28958A", "A29510C" ], - "JN.1.58.1": [ + "JN.1.58.2": [ "C241T", "T670G", "C897A", @@ -196542,7 +196542,6 @@ "C21622T", "G21624C", "C21711T", - "T21740C", "G21941T", "T22032C", "C22033A", @@ -196554,6 +196553,7 @@ "A22556G", "G22577C", "G22578A", + "G22599C", "A22629C", "C22674T", "T22679C", @@ -196620,7 +196620,7 @@ "C28958A", "A29510C" ], - "JN.1.58.2": [ + "JN.1.58.3": [ "C241T", "T670G", "C897A", @@ -196660,6 +196660,7 @@ "C21618T", "C21622T", "G21624C", + "C21654T", "C21711T", "G21941T", "T22032C", @@ -196672,7 +196673,6 @@ "A22556G", "G22577C", "G22578A", - "G22599C", "A22629C", "C22674T", "T22679C", @@ -196739,7 +196739,7 @@ "C28958A", "A29510C" ], - "JN.1.58.3": [ + "JN.1.32.1": [ "C241T", "T670G", "C897A", @@ -196775,16 +196775,15 @@ "C18894T", "C19955T", "A20055G", - "A21137G", "C21618T", "C21622T", "G21624C", - "C21654T", "C21711T", "G21941T", "T22032C", "C22033A", "A22034G", + "G22111T", "T22200G", "C22208T", "C22295A", @@ -196821,6 +196820,7 @@ "T23075C", "G23222A", "C23271T", + "C23277T", "A23403G", "C23423T", "C23525T", @@ -197771,13 +197771,12 @@ "C29386T", "A29510C" ], - "XBB.1.16.2": [ + "XBB.1.16.6": [ "C241T", "A405G", "T670G", "C2790T", "C3037T", - "C3042A", "G4184A", "C4321T", "C9344T", @@ -197790,6 +197789,7 @@ "C10449A", "C11750T", "C11956T", + "A12397G", "T12730A", "C12880T", "C14408T", @@ -197828,6 +197828,7 @@ "G22895C", "T22896C", "G22898A", + "T22930A", "T22942G", "G22992A", "C22995G", @@ -197848,7 +197849,6 @@ "T24469A", "C25000T", "C25416T", - "G25429C", "C25584T", "C26060T", "C26270T", @@ -197872,7 +197872,7 @@ "C29386T", "A29510C" ], - "XBB.1.16.6": [ + "XBB.1.16.29": [ "C241T", "A405G", "T670G", @@ -197880,6 +197880,8 @@ "C3037T", "G4184A", "C4321T", + "C7081T", + "C7765T", "C9344T", "A9424G", "C9534T", @@ -197890,7 +197892,6 @@ "C10449A", "C11750T", "C11956T", - "A12397G", "T12730A", "C12880T", "C14408T", @@ -197929,7 +197930,7 @@ "G22895C", "T22896C", "G22898A", - "T22930A", + "T22912C", "T22942G", "G22992A", "C22995G", @@ -197946,6 +197947,7 @@ "C23604A", "C23854A", "G23948T", + "C24210T", "A24424T", "T24469A", "C25000T", @@ -197973,7 +197975,7 @@ "C29386T", "A29510C" ], - "XBB.1.16.29": [ + "XBB.1.16.31": [ "C241T", "A405G", "T670G", @@ -197981,8 +197983,8 @@ "C3037T", "G4184A", "C4321T", - "C7081T", "C7765T", + "T9004C", "C9344T", "A9424G", "C9534T", @@ -198031,7 +198033,6 @@ "G22895C", "T22896C", "G22898A", - "T22912C", "T22942G", "G22992A", "C22995G", @@ -198048,7 +198049,6 @@ "C23604A", "C23854A", "G23948T", - "C24210T", "A24424T", "T24469A", "C25000T", @@ -198076,16 +198076,16 @@ "C29386T", "A29510C" ], - "XBB.1.16.31": [ + "XBB.1.16.13": [ "C241T", "A405G", "T670G", + "G1820A", "C2790T", "C3037T", + "G3567A", "G4184A", "C4321T", - "C7765T", - "T9004C", "C9344T", "A9424G", "C9534T", @@ -198177,14 +198177,13 @@ "C29386T", "A29510C" ], - "XBB.1.16.13": [ + "FU.1": [ "C241T", "A405G", "T670G", - "G1820A", "C2790T", "C3037T", - "G3567A", + "T3802C", "G4184A", "C4321T", "C9344T", @@ -198245,6 +198244,7 @@ "A23055G", "A23063T", "T23075C", + "C23202T", "A23403G", "C23525T", "T23599G", @@ -198278,15 +198278,15 @@ "C29386T", "A29510C" ], - "FU.1": [ + "FU.2": [ "C241T", "A405G", "T670G", "C2790T", "C3037T", - "T3802C", "G4184A", "C4321T", + "C8692T", "C9344T", "A9424G", "C9534T", @@ -198379,7 +198379,7 @@ "C29386T", "A29510C" ], - "FU.2": [ + "FU.3": [ "C241T", "A405G", "T670G", @@ -198387,7 +198387,6 @@ "C3037T", "G4184A", "C4321T", - "C8692T", "C9344T", "A9424G", "C9534T", @@ -198396,6 +198395,7 @@ "C10198T", "G10447A", "C10449A", + "C11665T", "C11750T", "C11956T", "T12730A", @@ -198480,12 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"G28883C", + "C28958A", + "A29510C" + ], + "LB.1": [ "C241T", "T670G", "C897A", @@ -205490,6 +205610,7 @@ "T22032C", "C22033A", "A22034G", + "G22111T", "T22200G", "C22208T", "C22295A", @@ -205497,6 +205618,7 @@ "A22556G", "G22577C", "G22578A", + "G22599C", "A22629C", "C22674T", "T22679C", @@ -205514,6 +205636,7 @@ "C22916T", "T22917G", "T22926C", + "T22928C", "T22942A", "G22992A", "C22995A", @@ -205529,9 +205652,7 @@ "A23403G", "C23423T", "C23525T", - "G23593T", "T23599G", - "C23601T", "C23604G", "C23854A", "G23948T", @@ -205563,10 +205684,9 @@ "G28882A", "G28883C", "C28958A", - "A29086T", "A29510C" ], - "JN.1.67.1": [ + "JN.1.18.6": [ "C241T", "T670G", "C897A", @@ -205574,7 +205694,6 @@ "C3037T", "G3431T", "T3565C", - "G4162A", "G4184A", "C4321T", "A6183G", @@ -205607,6 +205726,7 @@ "C21622T", "G21624C", "C21711T", + "T21738C", "G21941T", "T22032C", "C22033A", @@ -205618,6 +205738,7 @@ "A22556G", "G22577C", "G22578A", + "G22599C", "A22629C", "C22674T", "T22679C", @@ -205667,7 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-208491,6 +208488,7 @@ "G22895C", "T22896C", "G22898A", + "A22920T", "T22942G", "G22992A", "C22995G", @@ -208501,6 +208499,7 @@ "A23055G", "A23063T", "T23075C", + "C23202T", "A23403G", "C23525T", "T23599G", @@ -208527,20 +208526,24 @@ "A28271T", "T28297C", "C28311T", + "A28447G", "G28881A", "G28882A", "G28883C", + "C29386T", + "T29410C", "A29510C" ], - "FU.1.1": [ + "GY.6": [ "C241T", "A405G", "T670G", "C2790T", "C3037T", - "T3802C", + "C3042A", "G4184A", "C4321T", + "G5558A", "C9344T", "A9424G", "C9534T", @@ -208599,7 +208602,6 @@ "A23055G", "A23063T", "T23075C", - "C23202T", "A23403G", "C23525T", "T23599G", @@ -208609,14 +208611,13 @@ "A24424T", "T24469A", "C25000T", - "A25359G", "C25416T", + "G25429C", "C25584T", "C26060T", "C26270T", "A26275G", "C26577G", - "A26708G", "G26709A", "C26858T", "A27259C", @@ -208635,12 +208636,13 @@ "C29386T", "A29510C" ], - "FU.3.1": [ + "GY.4": [ "C241T", "A405G", "T670G", "C2790T", "C3037T", + "C3042A", "G4184A", "C4321T", "C9344T", @@ -208651,7 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"A23055G", "A23063T", "T23075C", - "C23202T", "A23403G", "C23525T", "T23599G", "C23604A", "C23854A", "G23948T", + "C24210T", "A24424T", "T24469A", "C25000T", "C25416T", + "G25429C", "C25584T", "C26060T", "C26270T", @@ -208841,14 +208841,16 @@ "C29386T", "A29510C" ], - "FU.4": [ + "GY.5": [ "C241T", "A405G", "T670G", "C2790T", "C3037T", + "C3042A", "G4184A", "C4321T", + "G9190C", "C9344T", "A9424G", "C9534T", @@ -208897,7 +208899,6 @@ "G22895C", "T22896C", "G22898A", - "A22920T", "T22942G", "G22992A", "C22995G", @@ -208908,7 +208909,6 @@ "A23055G", "A23063T", "T23075C", - "C23202T", "A23403G", "C23525T", "T23599G", @@ -208919,6 +208919,7 @@ "T24469A", "C25000T", "C25416T", + "G25429C", "C25584T", "C26060T", "C26270T", @@ -208940,7 +208941,6 @@ "G28882A", "G28883C", "C29386T", - "T29410C", "A29510C" ], "FL.13.4.1": [ @@ -219524,16 +219524,16 @@ "C29386T", "A29510C" ], - "GY.7": [ + "HF.1": [ "C241T", "A405G", "T670G", + "G1820A", "C2790T", "C3037T", - "C3042A", + "G3567A", "G4184A", "C4321T", - "G5515T", "C9344T", "A9424G", "C9534T", @@ -219542,7 +219542,6 @@ "C10198T", "G10447A", "C10449A", - "G11114T", "C11750T", "C11956T", "T12730A", @@ -219556,6 +219555,7 @@ "T16342C", "C17410T", "T17859C", + "C17949T", "A18163G", "G18703T", "A19326G", @@ -219568,6 +219568,7 @@ "C22109G", "T22200A", "G22317T", + "A22474C", "G22577C", "G22578A", "G22599C", @@ -219602,8 +219603,8 @@ "A24424T", "T24469A", "C25000T", + "C25006T", "C25416T", - "G25429C", "C25584T", "C26060T", "C26270T", @@ -219627,7 +219628,7 @@ "C29386T", "A29510C" ], - "GY.3": [ + "GY.7": [ "C241T", "A405G", "T670G", @@ -219636,6 +219637,7 @@ "C3042A", "G4184A", "C4321T", + "G5515T", "C9344T", "A9424G", "C9534T", @@ -219644,6 +219646,7 @@ "C10198T", "G10447A", "C10449A", + "G11114T", "C11750T", "C11956T", "T12730A", @@ -219665,7 +219668,6 @@ "C21618T", "T21810C", "C22000A", - "G22093C", "A22101T", "C22109G", "T22200A", @@ -219712,7 +219714,6 @@ "A26275G", "C26577G", "G26709A", - "C26753T", "C26858T", "A27259C", "G27382C", @@ -219730,7 +219731,7 @@ "C29386T", "A29510C" ], - "GY.1": [ + "GY.3": [ "C241T", "A405G", "T670G", @@ -219749,7 +219750,6 @@ "C10449A", "C11750T", "C11956T", - "G12467T", "T12730A", "C12880T", "C14408T", @@ -219768,8 +219768,8 @@ "A20055G", "C21618T", "T21810C", - "C21812A", "C22000A", + "G22093C", "A22101T", "C22109G", "T22200A", @@ -219816,6 +219816,7 @@ "A26275G", "C26577G", "G26709A", + "C26753T", "C26858T", "A27259C", "G27382C", @@ -219833,7 +219834,7 @@ "C29386T", "A29510C" ], - "GY.8": [ + "GY.1": [ "C241T", "A405G", "T670G", @@ -219852,6 +219853,7 @@ "C10449A", "C11750T", "C11956T", + "G12467T", "T12730A", "C12880T", "C14408T", @@ -219870,6 +219872,7 @@ "A20055G", "C21618T", "T21810C", + "C21812A", "C22000A", "A22101T", "C22109G", @@ -219890,7 +219893,6 @@ "G22895C", "T22896C", "G22898A", - "T22928C", "T22942G", "G22992A", "C22995G", @@ -219912,7 +219914,6 @@ "C25000T", "C25416T", "G25429C", - "C25452T", "C25584T", "C26060T", "C26270T", @@ -219936,7 +219937,7 @@ "C29386T", "A29510C" ], - "GY.9": [ + "GY.8": [ "C241T", "A405G", "T670G", @@ -219976,9 +219977,7 @@ "C22000A", "A22101T", "C22109G", - "T22119C", "T22200A", - "T22292C", "G22317T", "G22577C", "G22578A", @@ -219995,6 +219994,7 @@ "G22895C", "T22896C", "G22898A", + "T22928C", "T22942G", "G22992A", "C22995G", @@ -220016,6 +220016,7 @@ "C25000T", "C25416T", "G25429C", + "C25452T", "C25584T", "C26060T", "C26270T", @@ -220039,7 +220040,7 @@ "C29386T", "A29510C" ], - "GY.2.1": [ + "GY.9": [ "C241T", "A405G", "T670G", @@ -220079,9 +220080,10 @@ "C22000A", "A22101T", "C22109G", + "T22119C", "T22200A", + "T22292C", "G22317T", - "C22326T", "G22577C", "G22578A", "G22599C", @@ -220113,7 +220115,6 @@ "C23604A", "C23854A", "G23948T", - "C24210T", "A24424T", "T24469A", "C25000T", @@ -220142,14 +220143,13 @@ "C29386T", "A29510C" ], - "HF.1": [ + "GY.2.1": [ "C241T", "A405G", "T670G", - "G1820A", "C2790T", "C3037T", - "G3567A", + "C3042A", "G4184A", "C4321T", "C9344T", @@ -220173,7 +220173,6 @@ 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"C22995G", @@ -235991,11 +235990,11 @@ "C23604A", "C23854A", "G23948T", + "T23986C", "A24424T", "T24469A", "C25000T", "C25416T", - "G25429C", "C25584T", "C26060T", "C26270T", @@ -236019,15 +236018,17 @@ "C29386T", "A29510C" ], - "JF.1": [ + "HF.1.2": [ "C241T", "A405G", "T670G", + "G1820A", "C2790T", "C3037T", + "G3567A", + "C3737T", "G4184A", "C4321T", - "C8947T", "C9344T", "A9424G", "C9534T", @@ -236036,10 +236037,8 @@ "C10198T", "G10447A", "C10449A", - "A10861G", "C11750T", "C11956T", - "A12397G", "T12730A", "C12880T", "C14408T", @@ -236051,6 +236050,7 @@ "T16342C", "C17410T", "T17859C", + "C17949T", "A18163G", "G18703T", "A19326G", @@ -236063,6 +236063,7 @@ "C22109G", "T22200A", "G22317T", + "A22474C", "G22577C", "G22578A", "G22599C", @@ -236078,8 +236079,6 @@ "G22895C", "T22896C", "G22898A", - "G22927T", - "T22930A", "T22942G", "G22992A", "C22995G", @@ -236094,12 +236093,13 @@ "C23525T", "T23599G", "C23604A", + "C23625T", "C23854A", "G23948T", - "T23986C", "A24424T", "T24469A", 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"G28068T", "A28271T", "C28311T", "G28881A", @@ -245194,10 +245194,11 @@ "C28958A", "A29510C" ], - "KP.3.1": [ + "KP.3.2": [ "C241T", "T670G", "C897A", + "A2611C", "C2790T", "C3037T", "G3431T", @@ -245223,7 +245224,6 @@ "C12880T", "T13339C", "C14408T", - "G15372T", "C15714T", "T15756A", "G17334T", @@ -245231,7 +245231,6 @@ "A18163G", "A18492G", "C18894T", - "A19722G", "C19955T", "A20055G", "C21618T", @@ -245258,6 +245257,7 @@ "G22775A", "A22786C", "G22813T", + "C22858T", "T22882G", "G22895C", "T22896A", @@ -254909,12 +254909,10 @@ "G29449T", "A29510C" ], - "KP.3.2.2": [ + "KP.3.1.4": [ "C241T", "T670G", "C897A", - "C1549T", - "A2611C", "C2790T", "C3037T", "G3431T", @@ -254940,13 +254938,16 @@ "C12880T", "T13339C", "C14408T", + "G15372T", "C15714T", "T15756A", "G17334T", "C17410T", "A18163G", + "C18490T", "A18492G", "C18894T", + "A19722G", "C19955T", "A20055G", "C21618T", @@ -254960,7 +254961,6 @@ "T22200G", "C22208T", "C22295A", - "T22334C", "C22353A", "A22556G", "G22577C", @@ -254974,7 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"T10093G", - "C10198T", - "G10447A", - "C10449A", - "G11042T", - "G11727A", - "C12789T", - "C12815T", - "C12880T", - "T13339C", - "C14408T", - "C15714T", - "T15756A", - "G17334T", - "C17410T", - "A18163G", - "A18492G", - "C18894T", - "C19955T", - "A20055G", - "C20104T", - "C21618T", - "C21622T", - "G21624C", - "C21627A", - "C21654T", - "C21711T", - "G21941T", - "T22032C", - "C22033A", - "A22034G", - "T22200G", - "C22208T", - "C22295A", - "C22353A", - "A22556G", - "G22577C", - "G22578A", - "G22599C", - "A22629C", - "C22674T", - "T22679C", - "C22686T", - "A22688G", - "G22770A", - "G22775A", - "A22786C", - "G22813T", - "T22882G", - "G22895C", - "T22896A", - "G22898A", - "A22910G", - "C22916T", - "T22917G", - "T22926C", - "T22928C", - "T22942A", - "G22992A", - "T23005A", - "G23012A", - "T23018C", - "T23019C", - "A23055G", - "A23063T", - "T23075C", - "G23222A", - "C23271T", - "A23403G", - "C23423T", - "C23525T", - "T23599G", - "C23604G", - "C23854A", - "G23948T", - "C24378T", - "A24424T", - "T24469A", - "G24872T", - "C24990T", - "C25000T", - "C25207T", - "C25584T", - "C25587T", - "C26060T", - "C26195T", - "C26270T", - "G26529C", - "C26577G", - "A26610G", - "C26681T", - "G26709A", - "C26833T", - "C26858T", - "A26927G", - "A27259C", - "G27382C", - "A27383T", - "T27384C", - "C27807T", - "T27810C", - "A28271T", - "C28311T", - "G28881A", - "G28882A", - "G28883C", - "C28958A", - "A29510C" - ], "KP.2.14": [ "C241T", "T670G", @@ -259416,18 +259288,16 @@ "C29386T", "A29510C" ], - "GY.1.1.1": [ + "JF.2": [ "C241T", "A405G", "T670G", - "C1091T", + "A976T", "C2790T", "C3037T", - "C3042A", - "C3117T", - "G3452A", "G4184A", "C4321T", + "C8947T", "C9344T", "A9424G", "C9534T", @@ -259436,15 +259306,14 @@ "C10198T", "G10447A", "C10449A", - "C11020T", + "A10861G", "C11750T", "C11956T", - "G12467T", + "A12397G", "T12730A", "C12880T", "C14408T", "A14856G", - "T15276C", "G15451A", "C15714T", "C15738T", @@ -259455,12 +259324,10 @@ "A18163G", "G18703T", "A19326G", - "C19380T", "C19955T", 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"T23600C", "C23604G", "C23854A", "G23948T", @@ -267366,7 +267241,6 @@ "G24872T", "C24990T", "C25000T", - "C25006T", "C25207T", "C25584T", "C26060T", @@ -267385,16 +267259,14 @@ "C27807T", "T27810C", "A28271T", - "C28291A", "C28311T", "G28881A", "G28882A", "G28883C", - "G28884C", "C28958A", "A29510C" ], - "KP.3.1.1": [ + "KP.3.1.10": [ "C241T", "T670G", "C897A", @@ -267418,11 +267290,10 @@ "C10449A", "G11042T", "G11727A", - "C12616T", + "G12014A", "C12789T", "C12815T", "C12880T", - "A13121T", "T13339C", "C14408T", "G15372T", @@ -267444,6 +267315,7 @@ "T22032C", "C22033A", "A22034G", + "A22115G", "T22200G", "C22208T", "C22295A", @@ -267520,7 +267392,7 @@ "C28958A", "A29510C" ], - "MM.1": [ + "KP.3.1.8": [ "C241T", "T670G", "C897A", @@ -267535,6 +267407,7 @@ "A7842G", "C8293T", "G8393A", + "A9235G", "C9344T", "A9424G", "C9534T", @@ -267555,7 +267428,6 @@ "G17334T", "C17410T", "A18163G", - "C18490T", "A18492G", "C18894T", "A19722G", @@ -267565,6 +267437,7 @@ "C21622T", "G21624C", "C21711T", + "T21738C", "G21941T", "T22032C", "C22033A", @@ -267611,7 +267484,6 @@ "C23423T", "C23525T", "T23599G", - "T23600C", "C23604G", "C23854A", "G23948T", @@ -267646,7 +267518,7 @@ "C28958A", "A29510C" ], - "KP.3.1.10": [ + "KP.3.1.3": [ "C241T", "T670G", "C897A", @@ -267670,7 +267542,6 @@ "C10449A", "G11042T", "G11727A", - "G12014A", "C12789T", "C12815T", "C12880T", @@ -267690,12 +267561,12 @@ "C21618T", "C21622T", "G21624C", + "C21654T", "C21711T", "G21941T", "T22032C", "C22033A", "A22034G", - "A22115G", "T22200G", "C22208T", "C22295A", @@ -267749,6 +267620,7 @@ "C25000T", "C25207T", "C25584T", + "G25644T", "C26060T", "C26270T", "G26529C", @@ -267772,7 +267644,7 @@ "C28958A", "A29510C" ], - "KP.3.1.8": [ + "MK.1": [ "C241T", "T670G", "C897A", @@ -267787,7 +267659,6 @@ "A7842G", "C8293T", "G8393A", - "A9235G", "C9344T", "A9424G", "C9534T", @@ -267810,14 +267681,15 @@ "A18163G", "A18492G", "C18894T", + "T19305C", "A19722G", "C19955T", "A20055G", "C21618T", "C21622T", "G21624C", + "C21654T", "C21711T", - "T21738C", "G21941T", "T22032C", "C22033A", @@ -267898,7 +267770,7 @@ "C28958A", "A29510C" ], - "KP.3.1.3": [ + "KP.3.1.2": [ "C241T", "T670G", "C897A", @@ -267922,6 +267794,7 @@ "C10449A", "G11042T", "G11727A", + "C12616T", "C12789T", "C12815T", "C12880T", @@ -267941,9 +267814,9 @@ "C21618T", "C21622T", "G21624C", - "C21654T", "C21711T", "G21941T", + "G22014T", "T22032C", "C22033A", "A22034G", @@ -268000,7 +267873,6 @@ "C25000T", "C25207T", "C25584T", - "G25644T", "C26060T", "C26270T", "G26529C", @@ -268010,6 +267882,7 @@ "G26709A", "C26833T", "C26858T", + "C27143T", "A27259C", "G27382C", "A27383T", @@ -268024,10 +267897,11 @@ "C28958A", "A29510C" ], - "MK.1": [ + "KP.3.2.3": [ "C241T", "T670G", "C897A", + "A2611C", "C2790T", "C3037T", "G3431T", @@ -268047,13 +267921,13 @@ "G10447A", "C10449A", "G11042T", + "C11518T", "G11727A", "C12789T", "C12815T", "C12880T", "T13339C", "C14408T", - "G15372T", "C15714T", "T15756A", "G17334T", @@ -268061,14 +267935,11 @@ "A18163G", "A18492G", "C18894T", - "T19305C", - "A19722G", "C19955T", "A20055G", "C21618T", "C21622T", "G21624C", - "C21654T", "C21711T", "G21941T", "T22032C", @@ -268090,6 +267961,7 @@ "G22775A", "A22786C", "G22813T", + "C22858T", "T22882G", "G22895C", "T22896A", @@ -268126,6 +267998,7 @@ "C24990T", "C25000T", "C25207T", + "T25510C", "C25584T", "C26060T", "C26270T", @@ -268150,10 +268023,12 @@ "C28958A", "A29510C" ], - "KP.3.1.2": [ + "KP.3.2.5": [ "C241T", "T670G", "C897A", + "C1093T", + "A2611C", "C2790T", "C3037T", "G3431T", @@ -268174,13 +268049,11 @@ "C10449A", "G11042T", "G11727A", - "C12616T", "C12789T", "C12815T", "C12880T", "T13339C", "C14408T", - "G15372T", "C15714T", "T15756A", "G17334T", @@ -268188,15 +268061,14 @@ "A18163G", "A18492G", "C18894T", - "A19722G", "C19955T", "A20055G", "C21618T", "C21622T", "G21624C", "C21711T", + "G21746T", "G21941T", - "G22014T", "T22032C", "C22033A", "A22034G", @@ -268216,6 +268088,7 @@ "G22775A", "A22786C", "G22813T", + "C22858T", "T22882G", "G22895C", "T22896A", @@ -268262,7 +268135,6 @@ "G26709A", "C26833T", "C26858T", - "C27143T", "A27259C", "G27382C", "A27383T", @@ -270299,6 +270171,134 @@ "C28958A", "A29510C" ], + "XEN": [ + "C241T", + "T670G", + "C897A", + "C2790T", + "C3037T", + "G3431T", + "T3565C", + "G4184A", + "C4321T", + "A6183G", + "C7113T", + "A7842G", + "C8293T", + "G8393A", + "C9344T", + "A9424G", + "C9534T", + "C10029T", + "T10093G", + "C10198T", + "G10447A", + "C10449A", + "G11042T", + "G11727A", + "C12789T", + "C12815T", + "C12880T", + "T13339C", + "C14408T", + "C15714T", + "T15756A", + "G17334T", + "C17410T", + "A18163G", + "A18492G", + "C18894T", + "C19955T", + "A20055G", + "C20104T", + "C21618T", + "C21622T", + "G21624C", + "C21627A", + "C21654T", + "C21711T", + "G21941T", + "T22032C", + "C22033A", + "A22034G", + "T22200G", + "C22208T", + "C22295A", + "C22353A", + "A22556G", + "G22577C", + "G22578A", + "G22599C", + "A22629C", + "C22674T", + "T22679C", + "C22686T", + "A22688G", + "G22770A", + "G22775A", + "A22786C", + "G22813T", + "T22882G", + "G22895C", + "T22896A", + "G22898A", + "A22910G", + "C22916T", + "T22917G", + "T22926C", + "T22928C", + "T22942A", + "G22992A", + "T23005A", + "G23012A", + "T23018C", + "T23019C", + "A23055G", + "A23063T", + "T23075C", + "G23222A", + "C23271T", + "A23403G", + "C23423T", + "C23525T", + "T23599G", + "C23604G", + "C23854A", + "G23948T", + "C24378T", + "A24424T", + "T24469A", + "G24872T", + "C24990T", + "C25000T", + "C25207T", + "C25584T", + "C25587T", + "C26060T", + "C26195T", + "C26270T", + "G26529C", + "C26577G", + "A26610G", + "C26681T", + "G26709A", + "C26833T", + "C26858T", + "A26927G", + "A27259C", + "G27382C", + "A27383T", + "T27384C", + "C27807T", + "T27810C", + "A28271T", + "C28311T", + "G28881A", + "G28882A", + "G28883C", + "C28958A", + "A29510C" + ], "LZ.1.1": [ "C241T", "T670G", @@ -274284,11 +274284,10 @@ "A29510C", "T29637A" ], - "LW.1": [ + "ML.1": [ "C241T", "T670G", "C897A", - "A2611C", "C2790T", "C3037T", "G3431T", @@ -274301,14 +274300,13 @@ "C8293T", "G8393A", "C9344T", - "A9424G", + "A9424T", "C9534T", "C10029T", "C10198T", "G10447A", "C10449A", "G11042T", - "C11518T", "G11727A", "C12789T", "C12815T", @@ -274332,7 +274330,6 @@ "T22032C", "C22033A", "A22034G", - "A22106G", "T22200G", "C22208T", "C22295A", @@ -274349,7 +274346,6 @@ "G22775A", "A22786C", "G22813T", - "C22858T", "T22882G", "G22895C", "T22896A", @@ -274376,7 +274372,7 @@ "C23423T", "C23525T", "T23599G", - "C23604G", + "C23604A", "C23854A", "G23948T", "C24378T", @@ -274385,8 +274381,8 @@ "G24872T", "C24990T", "C25000T", + "C25006T", "C25207T", - "T25510C", "C25584T", "C26060T", "C26270T", @@ -274404,21 +274400,21 @@ "C27807T", "T27810C", "A28271T", + "C28291A", "C28311T", "G28881A", "G28882A", "G28883C", + "G28884C", "C28958A", "A29510C" ], - "KP.3.2.9": [ + "ML.2": [ "C241T", "T670G", "C897A", - "A2611C", "C2790T", "C3037T", - "A3064G", "G3431T", "T3565C", "G4184A", @@ -274429,7 +274425,7 @@ "C8293T", "G8393A", "C9344T", - "A9424G", + "A9424T", "C9534T", "C10029T", "C10198T", @@ -274444,7 +274440,6 @@ "C14408T", "C15714T", "T15756A", - "T16723C", "G17334T", "C17410T", "A18163G", @@ -274452,7 +274447,6 @@ "C18894T", "C19955T", "A20055G", - "A21137G", "C21618T", "C21622T", "G21624C", @@ -274477,7 +274471,6 @@ "G22775A", "A22786C", "G22813T", - "C22858T", "T22882G", "G22895C", "T22896A", @@ -274503,6 +274496,7 @@ "A23403G", "C23423T", "C23525T", + "G23593T", "T23599G", "C23604G", "C23854A", @@ -274513,6 +274507,7 @@ "G24872T", "C24990T", "C25000T", + "C25006T", "C25207T", "C25584T", "C26060T", @@ -274531,18 +274526,19 @@ "C27807T", "T27810C", "A28271T", + "C28291A", "C28311T", "G28881A", "G28882A", "G28883C", + "G28884C", "C28958A", "A29510C" ], - "KP.3.2.8": [ + "KP.3.3.2": [ "C241T", "T670G", "C897A", - "A2611C", "C2790T", "C3037T", "G3431T", @@ -274563,12 +274559,12 @@ "C10449A", "G11042T", "G11727A", + "A12666C", "C12789T", "C12815T", "C12880T", "T13339C", "C14408T", - "C14790T", "C15714T", "T15756A", "G17334T", @@ -274576,10 +274572,8 @@ "A18163G", "A18492G", "C18894T", - "C18981T", "C19955T", "A20055G", - "C21590T", "C21618T", "C21622T", "G21624C", @@ -274604,7 +274598,7 @@ "G22775A", "A22786C", "G22813T", - "C22858T", + "G22865T", "T22882G", "G22895C", "T22896A", @@ -274640,6 +274634,7 @@ "G24872T", "C24990T", "C25000T", + "C25006T", "C25207T", "C25584T", "C26060T", @@ -274658,18 +274653,19 @@ "C27807T", "T27810C", "A28271T", + "C28291A", "C28311T", "G28881A", "G28882A", "G28883C", + "G28884C", "C28958A", "A29510C" ], - "KP.3.2.6": [ + "MC.8": [ "C241T", "T670G", "C897A", - "A2611C", "C2790T", "C3037T", "G3431T", @@ -274684,18 +274680,21 @@ "C9344T", "A9424G", "C9534T", + "C9803T", "C10029T", "C10198T", "G10447A", "C10449A", "G11042T", "G11727A", - "G11761A", + "C12616T", "C12789T", "C12815T", "C12880T", + "A13121T", "T13339C", "C14408T", + "G15372T", "C15714T", "T15756A", "G17334T", @@ -274703,12 +274702,12 @@ "A18163G", "A18492G", "C18894T", + "A19722G", "C19955T", "A20055G", "C21618T", "C21622T", "G21624C", - "T21653C", "C21711T", "G21941T", "T22032C", @@ -274730,7 +274729,6 @@ "G22775A", "A22786C", "G22813T", - "C22858T", "T22882G", "G22895C", "T22896A", @@ -274768,7 +274766,6 @@ "C25000T", "C25207T", "C25584T", - "G25617A", "C26060T", "C26270T", "G26529C", @@ -274792,7 +274789,7 @@ "C28958A", "A29510C" ], - "ML.1": [ + "MC.5": [ "C241T", "T670G", "C897A", @@ -274808,7 +274805,7 @@ "C8293T", "G8393A", "C9344T", - "A9424T", + "A9424G", "C9534T", "C10029T", "C10198T", @@ -274816,11 +274813,14 @@ "C10449A", "G11042T", "G11727A", + "C12616T", "C12789T", "C12815T", "C12880T", + "A13121T", "T13339C", "C14408T", + "G15372T", "C15714T", "T15756A", "G17334T", @@ -274828,6 +274828,7 @@ "A18163G", "A18492G", "C18894T", + "A19722G", "C19955T", "A20055G", "C21618T", @@ -274880,7 +274881,7 @@ "C23423T", "C23525T", "T23599G", - "C23604A", + "C23604G", "C23854A", "G23948T", "C24378T", @@ -274889,8 +274890,8 @@ "G24872T", "C24990T", "C25000T", - "C25006T", "C25207T", + "G25217T", "C25584T", "C26060T", "C26270T", @@ -274908,16 +274909,14 @@ "C27807T", "T27810C", "A28271T", - "C28291A", "C28311T", "G28881A", "G28882A", "G28883C", - "G28884C", "C28958A", "A29510C" ], - "ML.2": [ + "MC.12": [ "C241T", "T670G", "C897A", @@ -274933,7 +274932,7 @@ "C8293T", "G8393A", "C9344T", - "A9424T", + "A9424G", "C9534T", "C10029T", "C10198T", @@ -274941,11 +274940,14 @@ "C10449A", "G11042T", "G11727A", + "C12616T", "C12789T", "C12815T", "C12880T", + "A13121T", "T13339C", "C14408T", + "G15372T", "C15714T", "T15756A", "G17334T", @@ -274953,12 +274955,14 @@ "A18163G", "A18492G", "C18894T", + "A19722G", "C19955T", "A20055G", "C21618T", "C21622T", "G21624C", "C21711T", + "G21777A", "G21941T", "T22032C", "C22033A", @@ -275004,7 +275008,6 @@ "A23403G", "C23423T", "C23525T", - "G23593T", "T23599G", "C23604G", "C23854A", @@ -275015,7 +275018,6 @@ "G24872T", "C24990T", "C25000T", - "C25006T", "C25207T", "C25584T", "C26060T", @@ -275034,16 +275036,14 @@ "C27807T", "T27810C", "A28271T", - "C28291A", "C28311T", "G28881A", "G28882A", "G28883C", - "G28884C", "C28958A", "A29510C" ], - "KP.3.3.2": [ + "MC.22": [ "C241T", "T670G", "C897A", @@ -275065,14 +275065,17 @@ "C10198T", "G10447A", "C10449A", + "C11020T", "G11042T", "G11727A", - "A12666C", + "C12616T", "C12789T", "C12815T", "C12880T", + "A13121T", "T13339C", "C14408T", + "G15372T", "C15714T", "T15756A", "G17334T", @@ -275080,6 +275083,7 @@ "A18163G", "A18492G", "C18894T", + "A19722G", "C19955T", "A20055G", "C21618T", @@ -275106,7 +275110,6 @@ "G22775A", "A22786C", "G22813T", - "G22865T", "T22882G", "G22895C", "T22896A", @@ -275142,7 +275145,6 @@ "G24872T", "C24990T", "C25000T", - "C25006T", "C25207T", "C25584T", "C26060T", @@ -275161,16 +275163,14 @@ "C27807T", "T27810C", "A28271T", - "C28291A", "C28311T", "G28881A", "G28882A", "G28883C", - "G28884C", "C28958A", "A29510C" ], - "MC.8": [ + "MC.7": [ "C241T", "T670G", "C897A", @@ -275182,13 +275182,13 @@ "C4321T", "A6183G", "C7113T", + "A7330T", "A7842G", "C8293T", "G8393A", "C9344T", "A9424G", "C9534T", - "C9803T", "C10029T", "C10198T", "G10447A", @@ -275233,6 +275233,7 @@ "T22679C", "C22686T", "A22688G", + "C22752T", "G22770A", "G22775A", "A22786C", @@ -275297,7 +275298,7 @@ "C28958A", "A29510C" ], - "MC.5": [ + "MC.1": [ "C241T", "T670G", "C897A", @@ -275385,6 +275386,7 @@ "T23075C", "G23222A", "C23271T", + "C23277T", "A23403G", "C23423T", "C23525T", @@ -275399,7 +275401,6 @@ "C24990T", "C25000T", "C25207T", - "G25217T", "C25584T", "C26060T", "C26270T", @@ -275424,9 +275425,10 @@ "C28958A", "A29510C" ], - "MC.12": [ + "MC.21": [ "C241T", "T670G", + "C829T", "C897A", "C2790T", "C3037T", @@ -275470,7 +275472,6 @@ "C21622T", "G21624C", "C21711T", - "G21777A", "G21941T", "T22032C", "C22033A", @@ -275551,7 +275552,7 @@ "C28958A", "A29510C" ], - "MC.22": [ + "MC.4": [ "C241T", "T670G", "C897A", @@ -275573,7 +275574,6 @@ "C10198T", "G10447A", "C10449A", - "C11020T", "G11042T", "G11727A", "C12616T", @@ -275598,6 +275598,7 @@ "C21622T", "G21624C", "C21711T", + "C21855T", "G21941T", "T22032C", "C22033A", @@ -275678,7 +275679,7 @@ "C28958A", "A29510C" ], - "MC.7": [ + "MC.13": [ "C241T", "T670G", "C897A", @@ -275690,7 +275691,6 @@ "C4321T", "A6183G", "C7113T", - "A7330T", "A7842G", "C8293T", "G8393A", @@ -275701,6 +275701,7 @@ "C10198T", "G10447A", "C10449A", + "C10681T", "G11042T", "G11727A", "C12616T", @@ -275741,7 +275742,6 @@ "T22679C", "C22686T", "A22688G", - "C22752T", "G22770A", "G22775A", "A22786C", @@ -275806,7 +275806,7 @@ "C28958A", "A29510C" ], - "MC.1": [ + "MC.14": [ "C241T", "T670G", "C897A", @@ -275859,6 +275859,7 @@ "T22200G", "C22208T", "C22295A", + "C22338G", "C22353A", "A22556G", "G22577C", @@ -275894,7 +275895,6 @@ "T23075C", "G23222A", "C23271T", - "C23277T", "A23403G", "C23423T", "C23525T", @@ -275933,10 +275933,9 @@ "C28958A", "A29510C" ], - "MC.21": [ + "MC.15": [ "C241T", "T670G", - "C829T", "C897A", "C2790T", "C3037T", @@ -275984,6 +275983,7 @@ "T22032C", "C22033A", "A22034G", + "A22107G", "T22200G", "C22208T", "C22295A", @@ -276060,7 +276060,7 @@ "C28958A", "A29510C" ], - "MC.4": [ + "MC.19": [ "C241T", "T670G", "C897A", @@ -276106,7 +276106,6 @@ "C21622T", "G21624C", "C21711T", - "C21855T", "G21941T", "T22032C", "C22033A", @@ -276118,6 +276117,7 @@ "A22556G", "G22577C", "G22578A", + "G22599C", "A22629C", "C22674T", "T22679C", @@ -276187,7 +276187,7 @@ "C28958A", "A29510C" ], - "MC.13": [ + "MC.2": [ "C241T", "T670G", "C897A", @@ -276209,7 +276209,6 @@ "C10198T", "G10447A", "C10449A", - "C10681T", "G11042T", "G11727A", "C12616T", @@ -276283,6 +276282,7 @@ "C23604G", "C23854A", "G23948T", + "G24095T", "C24378T", "A24424T", "T24469A", @@ -276314,7 +276314,7 @@ "C28958A", "A29510C" ], - "MC.14": [ + "MC.10": [ "C241T", "T670G", "C897A", @@ -276348,6 +276348,7 @@ "G15372T", "C15714T", "T15756A", + "C16332T", "G17334T", "C17410T", "A18163G", @@ -276367,7 +276368,6 @@ "T22200G", "C22208T", "C22295A", - "C22338G", "C22353A", "A22556G", "G22577C", @@ -276441,11 +276441,12 @@ "C28958A", "A29510C" ], - "MC.15": [ + "MC.16": [ "C241T", "T670G", "C897A", "C2790T", + "G2890A", "C3037T", "G3431T", "T3565C", @@ -276491,7 +276492,6 @@ "T22032C", "C22033A", "A22034G", - "A22107G", "T22200G", "C22208T", "C22295A", @@ -276568,7 +276568,7 @@ "C28958A", "A29510C" ], - "MC.19": [ + "MC.11": [ "C241T", "T670G", "C897A", @@ -276604,6 +276604,7 @@ "T15756A", "G17334T", "C17410T", + "C17430T", "A18163G", "A18492G", "C18894T", @@ -276625,7 +276626,6 @@ "A22556G", "G22577C", "G22578A", - "G22599C", "A22629C", "C22674T", "T22679C", @@ -276695,7 +276695,7 @@ "C28958A", "A29510C" ], - "MC.2": [ + "MM.2": [ "C241T", "T670G", "C897A", @@ -276719,11 +276719,9 @@ "C10449A", "G11042T", "G11727A", - "C12616T", "C12789T", "C12815T", "C12880T", - "A13121T", "T13339C", "C14408T", "G15372T", @@ -276732,6 +276730,7 @@ "G17334T", "C17410T", "A18163G", + "C18490T", "A18492G", "C18894T", "A19722G", @@ -276740,11 +276739,13 @@ "C21618T", "C21622T", "G21624C", + "G21665C", "C21711T", "G21941T", "T22032C", "C22033A", "A22034G", + "A22115G", "T22200G", "C22208T", "C22295A", @@ -276790,7 +276791,6 @@ "C23604G", "C23854A", "G23948T", - "G24095T", "C24378T", "A24424T", "T24469A", @@ -276822,10 +276822,11 @@ "C28958A", "A29510C" ], - "MC.10": [ + "MY.1": [ "C241T", "T670G", "C897A", + "C1498T", "C2790T", "C3037T", "G3431T", @@ -276837,6 +276838,7 @@ "A7842G", "C8293T", "G8393A", + "A9235G", "C9344T", "A9424G", "C9534T", @@ -276846,17 +276848,14 @@ "C10449A", "G11042T", "G11727A", - "C12616T", "C12789T", "C12815T", "C12880T", - "A13121T", "T13339C", "C14408T", "G15372T", "C15714T", "T15756A", - "C16332T", "G17334T", "C17410T", "A18163G", @@ -276869,10 +276868,12 @@ "C21622T", "G21624C", "C21711T", + "T21738C", "G21941T", "T22032C", "C22033A", "A22034G", + "C22082T", "T22200G", "C22208T", "C22295A", @@ -276925,6 +276926,7 @@ "C24990T", "C25000T", "C25207T", + "C25583T", "C25584T", "C26060T", "C26270T", @@ -276949,13 +276951,13 @@ "C28958A", "A29510C" ], - "MC.16": [ + "KP.3.1.5": [ "C241T", "T670G", "C897A", "C2790T", - "G2890A", "C3037T", + "G3259T", "G3431T", "T3565C", "G4184A", @@ -276974,11 +276976,9 @@ "C10449A", "G11042T", "G11727A", - "C12616T", "C12789T", "C12815T", "C12880T", - "A13121T", "T13339C", "C14408T", "G15372T", @@ -277037,6 +277037,7 @@ "A23063T", "T23075C", "G23222A", + "C23230A", "C23271T", "A23403G", "C23423T", @@ -277053,6 +277054,7 @@ "C25000T", "C25207T", "C25584T", + "A25948G", "C26060T", "C26270T", "G26529C", @@ -277076,7 +277078,7 @@ "C28958A", "A29510C" ], - "MC.11": [ + "MK.2": [ "C241T", "T670G", "C897A", @@ -277100,11 +277102,9 @@ "C10449A", "G11042T", "G11727A", - "C12616T", "C12789T", "C12815T", "C12880T", - "A13121T", "T13339C", "C14408T", "G15372T", @@ -277112,10 +277112,10 @@ "T15756A", "G17334T", "C17410T", - "C17430T", "A18163G", "A18492G", "C18894T", + "T19305C", "A19722G", "C19955T", "A20055G", @@ -277170,6 +277170,7 @@ "C23525T", "T23599G", "C23604G", + "A23796G", "C23854A", "G23948T", "C24378T", @@ -277182,6 +277183,7 @@ "C25584T", "C26060T", "C26270T", + "C26305T", "G26529C", "C26577G", "A26610G", @@ -277203,10 +277205,11 @@ "C28958A", "A29510C" ], - "MM.2": [ + "LW.1": [ "C241T", "T670G", "C897A", + "A2611C", "C2790T", "C3037T", "G3431T", @@ -277226,34 +277229,31 @@ "G10447A", "C10449A", "G11042T", + "C11518T", "G11727A", "C12789T", "C12815T", "C12880T", "T13339C", "C14408T", - "G15372T", "C15714T", "T15756A", "G17334T", "C17410T", "A18163G", - "C18490T", "A18492G", "C18894T", - "A19722G", "C19955T", "A20055G", "C21618T", "C21622T", "G21624C", - "G21665C", "C21711T", "G21941T", "T22032C", "C22033A", "A22034G", - "A22115G", + "A22106G", "T22200G", "C22208T", "C22295A", @@ -277270,6 +277270,7 @@ "G22775A", "A22786C", "G22813T", + "C22858T", "T22882G", "G22895C", "T22896A", @@ -277306,6 +277307,7 @@ "C24990T", "C25000T", "C25207T", + "T25510C", "C25584T", "C26060T", "C26270T", @@ -277330,13 +277332,14 @@ "C28958A", "A29510C" ], - "MY.1": [ + "KP.3.2.9": [ "C241T", "T670G", "C897A", - "C1498T", + "A2611C", "C2790T", "C3037T", + "A3064G", "G3431T", "T3565C", "G4184A", @@ -277346,7 +277349,6 @@ "A7842G", "C8293T", "G8393A", - "A9235G", "C9344T", "A9424G", "C9534T", @@ -277361,27 +277363,25 @@ "C12880T", "T13339C", "C14408T", - "G15372T", "C15714T", "T15756A", + "T16723C", "G17334T", "C17410T", "A18163G", "A18492G", "C18894T", - "A19722G", "C19955T", "A20055G", + "A21137G", "C21618T", "C21622T", "G21624C", "C21711T", - "T21738C", "G21941T", "T22032C", "C22033A", "A22034G", - "C22082T", "T22200G", "C22208T", "C22295A", @@ -277398,6 +277398,7 @@ "G22775A", "A22786C", "G22813T", + "C22858T", "T22882G", "G22895C", "T22896A", @@ -277434,7 +277435,6 @@ "C24990T", "C25000T", "C25207T", - "C25583T", "C25584T", "C26060T", "C26270T", @@ -277459,13 +277459,13 @@ "C28958A", "A29510C" ], - "KP.3.1.5": [ + "KP.3.2.8": [ "C241T", "T670G", "C897A", + "A2611C", "C2790T", "C3037T", - "G3259T", "G3431T", "T3565C", "G4184A", @@ -277489,7 +277489,7 @@ "C12880T", "T13339C", "C14408T", - "G15372T", + "C14790T", "C15714T", "T15756A", "G17334T", @@ -277497,9 +277497,10 @@ "A18163G", "A18492G", "C18894T", - "A19722G", + "C18981T", "C19955T", "A20055G", + "C21590T", "C21618T", "C21622T", "G21624C", @@ -277524,6 +277525,7 @@ "G22775A", "A22786C", "G22813T", + "C22858T", "T22882G", "G22895C", "T22896A", @@ -277545,7 +277547,6 @@ "A23063T", "T23075C", "G23222A", - "C23230A", "C23271T", "A23403G", "C23423T", @@ -277562,7 +277563,6 @@ "C25000T", "C25207T", "C25584T", - "A25948G", "C26060T", "C26270T", "G26529C", @@ -277586,10 +277586,11 @@ "C28958A", "A29510C" ], - "MK.2": [ + "KP.3.2.6": [ "C241T", "T670G", "C897A", + "A2611C", "C2790T", "C3037T", "G3431T", @@ -277610,12 +277611,12 @@ "C10449A", "G11042T", "G11727A", + "G11761A", "C12789T", "C12815T", "C12880T", "T13339C", "C14408T", - "G15372T", "C15714T", "T15756A", "G17334T", @@ -277623,13 +277624,12 @@ "A18163G", "A18492G", "C18894T", - "T19305C", - "A19722G", "C19955T", "A20055G", "C21618T", "C21622T", "G21624C", + "T21653C", "C21711T", "G21941T", "T22032C", @@ -277651,6 +277651,7 @@ "G22775A", "A22786C", "G22813T", + "C22858T", "T22882G", "G22895C", "T22896A", @@ -277678,7 +277679,6 @@ "C23525T", "T23599G", "C23604G", - "A23796G", "C23854A", "G23948T", "C24378T", @@ -277689,9 +277689,9 @@ "C25000T", "C25207T", "C25584T", + "G25617A", "C26060T", "C26270T", - "C26305T", "G26529C", "C26577G", "A26610G", @@ -284960,23 +284960,23 @@ "C28958A", "A29510C" ], - "LW.1.1": [ + "MC.20": [ "C241T", "T670G", + "C853T", "C897A", - "A2611C", "C2790T", "C3037T", "G3431T", "T3565C", "G4184A", "C4321T", + "G5230T", "A6183G", "C7113T", "A7842G", "C8293T", "G8393A", - "C8639T", "C9344T", "A9424G", "C9534T", @@ -284985,13 +284985,15 @@ "G10447A", "C10449A", "G11042T", - "C11518T", "G11727A", + "C12616T", "C12789T", "C12815T", "C12880T", + "A13121T", "T13339C", "C14408T", + "G15372T", "C15714T", "T15756A", "G17334T", @@ -284999,12 +285001,12 @@ "A18163G", "A18492G", "C18894T", + "A19722G", "C19955T", "A20055G", "C21618T", "C21622T", "G21624C", - "C21660T", "C21711T", "G21941T", "T22032C", @@ -285027,7 +285029,6 @@ "G22775A", "A22786C", "G22813T", - "C22858T", "T22882G", "G22895C", "T22896A", @@ -285064,7 +285065,6 @@ "C24990T", "C25000T", "C25207T", - "T25510C", "C25584T", "C26060T", "C26270T", @@ -285089,11 +285089,10 @@ "C28958A", "A29510C" ], - "LW.1.2": [ + "MC.13.2": [ "C241T", "T670G", "C897A", - "A2611C", "C2790T", "C3037T", "G3431T", @@ -285112,34 +285111,35 @@ "C10198T", "G10447A", "C10449A", + "C10681T", "G11042T", - "C11518T", "G11727A", + "C12616T", "C12789T", "C12815T", "C12880T", + "A13121T", "T13339C", "C14408T", + "G15372T", "C15714T", "T15756A", "G17334T", - "C17373A", "C17410T", "A18163G", "A18492G", "C18894T", + "A19722G", "C19955T", "A20055G", "C21618T", "C21622T", "G21624C", - "C21627A", "C21711T", "G21941T", "T22032C", "C22033A", "A22034G", - "A22106G", "T22200G", "C22208T", "C22295A", @@ -285156,7 +285156,7 @@ "G22775A", "A22786C", "G22813T", - "C22858T", + "G22865T", "T22882G", 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"C241T", "T670G", - "C853T", "C897A", "C2790T", "C3037T", @@ -285361,7 +285356,6 @@ "T3565C", "G4184A", "C4321T", - "G5230T", "A6183G", "C7113T", "A7842G", @@ -285374,6 +285368,7 @@ "C10198T", "G10447A", "C10449A", + "C10681T", "G11042T", "G11727A", "C12616T", @@ -285389,6 +285384,7 @@ "G17334T", "C17410T", "A18163G", + "C18388T", "A18492G", "C18894T", "A19722G", @@ -285402,10 +285398,10 @@ "T22032C", "C22033A", "A22034G", - "A22106G", "T22200G", "C22208T", "C22295A", + "C22323T", "C22353A", "A22556G", "G22577C", @@ -285479,7 +285475,7 @@ "C28958A", "A29510C" ], - "MC.13.2": [ + "MC.10.2": [ "C241T", "T670G", "C897A", @@ -285499,9 +285495,9 @@ "C9534T", "C10029T", "C10198T", + "A10323G", "G10447A", "C10449A", - "C10681T", "G11042T", "G11727A", "C12616T", @@ -285510,10 +285506,12 @@ "C12880T", "A13121T", "T13339C", + "T13804C", "C14408T", "G15372T", "C15714T", "T15756A", + "C16332T", "G17334T", "C17410T", "A18163G", @@ -285526,6 +285524,7 @@ "C21622T", "G21624C", "C21711T", + "T21864C", 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