siesta-3.0-ompi-iqtc02_tcsh.sub

#!/bin/bash 
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# SGE options and parameters
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# (1) Name of the job 
#$ -N test_siesta_iqtc02 
# (2) Recursos sol.licitats 
#$ -pe ompi 4
# Queue
#$ -q iqtc02.q
# Shell
#$ -S /bin/tcsh
# (3) Output files 
#$ -cwd 
#$ -o siesta_iqtc02-4.out 
#$ -e siesta_iqtc02-4.err 
# (4) Remove the first '#' of the following 2 lines if you want to receive an email when the job ends.
##$ -m e 
##$ -M yourmail@ub.edu
#$ -S /bin/tcsh
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# User environment 
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# Load the modules needed 
. /etc/profile.d/modules.csh
module load siesta/3.0-rc2_paralel_ompi

set INPUT=SnO2FC.fdf
set OUTPUT=$INPUT.log
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# Copying files needed 
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# We copy the inputs to the directory where the jobs will run 

cp -r * $TMPDIR/
cd $TMPDIR 
#cp -r $HOME/bench/SIESTA/XRQTC.SIESTA_SnO2_FCfullBZ/input/* .
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# Run the job 
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setenv OMP_NUM_THREADS 1

mpirun -np $NSLOTS siesta < $INPUT > $OUTPUT
########################################## 
# Copy the results to our home directory
########################################## 
mkdir -p $HOME/bench/SIESTA/XRQTC.SIESTA_SnO2_FCfullBZ/OUT_iqtc02
cp -r $TMPDIR $HOME/bench/SIESTA/XRQTC.SIESTA_SnO2_FCfullBZ/OUT_iqtc02